Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NRIP1P48552 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRIP1P48552 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms