Protein–RNA interactions for Protein: P47914

RPL29, 60S ribosomal protein L29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL29P47914 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL29P47914 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL29P47914 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL29P47914 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL29P47914 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL29P47914 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL29P47914 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL29P47914 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL29P47914 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL29P47914 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL29P47914 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL29P47914 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL29P47914 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL29P47914 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL29P47914 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL29P47914 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL29P47914 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL29P47914 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL29P47914 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL29P47914 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL29P47914 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL29P47914 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL29P47914 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL29P47914 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL29P47914 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL29P47914 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL29P47914 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL29P47914 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL29P47914 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL29P47914 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL29P47914 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL29P47914 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL29P47914 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL29P47914 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL29P47914 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL29P47914 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL29P47914 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL29P47914 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL29P47914 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL29P47914 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL29P47914 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL29P47914 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL29P47914 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL29P47914 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL29P47914 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL29P47914 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL29P47914 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL29P47914 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL29P47914 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL29P47914 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL29P47914 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL29P47914 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL29P47914 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL29P47914 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL29P47914 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL29P47914 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL29P47914 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL29P47914 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL29P47914 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL29P47914 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL29P47914 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL29P47914 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL29P47914 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL29P47914 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL29P47914 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL29P47914 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL29P47914 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL29P47914 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL29P47914 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL29P47914 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL29P47914 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL29P47914 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL29P47914 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL29P47914 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL29P47914 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL29P47914 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL29P47914 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL29P47914 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL29P47914 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL29P47914 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL29P47914 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL29P47914 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL29P47914 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL29P47914 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL29P47914 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL29P47914 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL29P47914 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL29P47914 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL29P47914 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL29P47914 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL29P47914 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL29P47914 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL29P47914 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL29P47914 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL29P47914 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL29P47914 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL29P47914 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL29P47914 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL29P47914 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL29P47914 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms