Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RECQLP46063 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RECQLP46063 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RECQLP46063 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RECQLP46063 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RECQLP46063 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RECQLP46063 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RECQLP46063 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RECQLP46063 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RECQLP46063 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RECQLP46063 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RECQLP46063 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RECQLP46063 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RECQLP46063 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RECQLP46063 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RECQLP46063 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RECQLP46063 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RECQLP46063 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RECQLP46063 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RECQLP46063 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RECQLP46063 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RECQLP46063 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RECQLP46063 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RECQLP46063 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RECQLP46063 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RECQLP46063 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RECQLP46063 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RECQLP46063 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RECQLP46063 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RECQLP46063 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RECQLP46063 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RECQLP46063 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RECQLP46063 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RECQLP46063 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RECQLP46063 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RECQLP46063 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RECQLP46063 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RECQLP46063 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RECQLP46063 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RECQLP46063 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RECQLP46063 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RECQLP46063 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RECQLP46063 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RECQLP46063 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RECQLP46063 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RECQLP46063 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RECQLP46063 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RECQLP46063 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RECQLP46063 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RECQLP46063 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RECQLP46063 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RECQLP46063 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RECQLP46063 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RECQLP46063 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RECQLP46063 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RECQLP46063 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RECQLP46063 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RECQLP46063 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RECQLP46063 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RECQLP46063 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RECQLP46063 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RECQLP46063 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RECQLP46063 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RECQLP46063 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RECQLP46063 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RECQLP46063 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RECQLP46063 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RECQLP46063 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RECQLP46063 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RECQLP46063 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RECQLP46063 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RECQLP46063 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RECQLP46063 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RECQLP46063 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RECQLP46063 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RECQLP46063 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RECQLP46063 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RECQLP46063 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RECQLP46063 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RECQLP46063 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RECQLP46063 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RECQLP46063 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RECQLP46063 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RECQLP46063 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RECQLP46063 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RECQLP46063 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RECQLP46063 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RECQLP46063 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RECQLP46063 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RECQLP46063 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RECQLP46063 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RECQLP46063 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RECQLP46063 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RECQLP46063 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RECQLP46063 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23■■□□□ 1.27
RECQLP46063 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RECQLP46063 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RECQLP46063 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RECQLP46063 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RECQLP46063 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms