Protein–RNA interactions for Protein: P43405

SYK, Tyrosine-protein kinase SYK, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYKP43405 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYKP43405 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYKP43405 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYKP43405 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYKP43405 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYKP43405 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYKP43405 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYKP43405 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYKP43405 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYKP43405 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYKP43405 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYKP43405 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYKP43405 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYKP43405 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYKP43405 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYKP43405 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYKP43405 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYKP43405 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYKP43405 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYKP43405 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYKP43405 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYKP43405 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYKP43405 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYKP43405 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYKP43405 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYKP43405 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYKP43405 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYKP43405 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYKP43405 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYKP43405 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYKP43405 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYKP43405 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYKP43405 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYKP43405 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYKP43405 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYKP43405 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYKP43405 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYKP43405 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYKP43405 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SYKP43405 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYKP43405 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYKP43405 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYKP43405 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYKP43405 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYKP43405 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYKP43405 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SYKP43405 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYKP43405 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYKP43405 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYKP43405 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYKP43405 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYKP43405 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYKP43405 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYKP43405 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYKP43405 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYKP43405 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYKP43405 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYKP43405 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYKP43405 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYKP43405 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYKP43405 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYKP43405 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SYKP43405 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYKP43405 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYKP43405 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYKP43405 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYKP43405 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYKP43405 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYKP43405 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYKP43405 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYKP43405 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYKP43405 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYKP43405 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYKP43405 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYKP43405 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYKP43405 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYKP43405 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYKP43405 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYKP43405 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYKP43405 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYKP43405 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYKP43405 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYKP43405 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYKP43405 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYKP43405 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYKP43405 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYKP43405 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYKP43405 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYKP43405 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYKP43405 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYKP43405 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYKP43405 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYKP43405 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYKP43405 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SYKP43405 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYKP43405 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SYKP43405 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SYKP43405 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYKP43405 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYKP43405 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms