Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NR4A2P43354 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms