Protein–RNA interactions for Protein: P43243

MATR3, Matrin-3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATR3P43243 ATP11C-207ENST00000460773 2750 ntTSL 52.83□□□□□ -1.962e-6■■■■■ 27.1
MATR3P43243 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.112e-6■■■■■ 27.1
MATR3P43243 NSD2-218ENST00000508355 2092 ntTSL 1 (best)15.21■□□□□ 0.036e-7■■■■■ 27.1
MATR3P43243 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.846e-7■■■■■ 27.1
MATR3P43243 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.966e-7■■■■■ 27.1
MATR3P43243 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.284e-7■■■■■ 27.1
MATR3P43243 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.966e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.076e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.166e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.918e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.738e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.618e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.088e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 ASXL1-204ENST00000470145 1073 ntTSL 510.92□□□□□ -0.668e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 CD46-214ENST00000480003 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 CD46-202ENST00000322918 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.815e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.845e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.95e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.925e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.935e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -15e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.035e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.035e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.035e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 CD46-212ENST00000469535 7826 ntTSL 1 (best)8.48□□□□□ -1.055e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 CD46-216ENST00000490278 747 ntTSL 23.78□□□□□ -1.85e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 CD46-213ENST00000471987 572 ntTSL 33.67□□□□□ -1.825e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 CD46-215ENST00000488596 872 ntTSL 33.11□□□□□ -1.915e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 CD46-210ENST00000462968 473 ntTSL 32.93□□□□□ -1.945e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 CD46-219ENST00000636114 2098 ntTSL 52.72□□□□□ -1.975e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 EYA3-203ENST00000373871 6085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.752e-9■■■■■ 27
MATR3P43243 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.962e-9■■■■■ 27
MATR3P43243 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.132e-9■■■■■ 27
MATR3P43243 ELL2-203ENST00000506628 520 ntTSL 522.54■■□□□ 1.24e-10■■■■■ 27
MATR3P43243 ELL2-206ENST00000513343 582 ntTSL 322.25■■□□□ 1.154e-10■■■■■ 27
MATR3P43243 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.894e-10■■■■■ 27
MATR3P43243 ARFGAP2-227ENST00000533243 1558 ntTSL 222.32■■□□□ 1.163e-6■■■■■ 27
MATR3P43243 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 27
MATR3P43243 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 27
MATR3P43243 ARFGAP2-212ENST00000527097 942 ntTSL 216.85■□□□□ 0.293e-6■■■■■ 27
MATR3P43243 ARFGAP2-220ENST00000529455 840 ntTSL 516.76■□□□□ 0.273e-6■■■■■ 27
MATR3P43243 ARFGAP2-207ENST00000525398 1000 ntTSL 315.99■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 27
MATR3P43243 ARFGAP2-226ENST00000532478 940 ntTSL 515.23■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 27
MATR3P43243 ARFGAP2-217ENST00000528444 730 ntTSL 515.23■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 27
MATR3P43243 ARFGAP2-206ENST00000525314 785 ntTSL 315.19■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 27
MATR3P43243 ARFGAP2-224ENST00000531750 649 ntTSL 415.19■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 27
MATR3P43243 ARFGAP2-201ENST00000395449 1772 ntTSL 514.75□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 27
MATR3P43243 ARFGAP2-214ENST00000527927 850 ntTSL 513.48□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 27
MATR3P43243 ARFGAP2-225ENST00000532438 740 ntTSL 412.74□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 27
MATR3P43243 ARFGAP2-205ENST00000524782 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.53e-6■■■■■ 27
MATR3P43243 ARFGAP2-210ENST00000526342 474 ntTSL 510.23□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 27
MATR3P43243 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 27
MATR3P43243 GAB2-206ENST00000530915 567 ntTSL 423.98■■□□□ 1.437e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 GAB2-203ENST00000526030 650 ntTSL 322.15■■□□□ 1.147e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 GAB2-207ENST00000534823 568 ntTSL 321.77■■□□□ 1.087e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.127e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 GAB2-205ENST00000528886 543 ntTSL 410.43□□□□□ -0.747e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.079e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 PIAS1-201ENST00000249636 8115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.989e-7■■■■■ 27
MATR3P43243 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.182e-6■■■■■ 27
MATR3P43243 RBM34-204ENST00000468751 648 ntTSL 217.93■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 27
MATR3P43243 ARID4B-211ENST00000474953 3463 ntTSL 215.05■□□□□ -02e-6■■■■■ 27
MATR3P43243 RBM34-202ENST00000429912 667 ntTSL 314□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 27
MATR3P43243 RBM34-205ENST00000474086 882 ntTSL 212.72□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 27
MATR3P43243 RBM34-207ENST00000476261 881 ntTSL 1 (best)11.61□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 27
MATR3P43243 RBM34-203ENST00000447801 1273 ntTSL 510.55□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 27
MATR3P43243 RBM34-206ENST00000475960 477 ntTSL 38.68□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 27
MATR3P43243 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.778e-7■■■■■ 26.9
MATR3P43243 ANO6-204ENST00000426898 2780 ntTSL 217.81■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 26.9
MATR3P43243 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 26.9
MATR3P43243 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 26.9
MATR3P43243 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.012e-6■■■■■ 26.9
MATR3P43243 HDLBP-217ENST00000430918 612 ntTSL 311.16□□□□□ -0.626e-7■■■■■ 26.9
MATR3P43243 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 26.9
MATR3P43243 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 26.9
MATR3P43243 WRN-203ENST00000521620 3593 ntTSL 1 (best)3.77□□□□□ -1.812e-13■■■■■ 26.9
MATR3P43243 TBC1D8-209ENST00000487392 373 ntTSL 514.98□□□□□ -0.014e-6■■■■■ 26.9
MATR3P43243 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.662e-7■■■■■ 26.9
MATR3P43243 ZNF496-202ENST00000461277 3857 ntTSL 1 (best)9.09□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 26.9
MATR3P43243 PTK2-255ENST00000524202 3014 ntTSL 1 (best)9.1□□□□□ -0.957e-7■■■■■ 26.9
MATR3P43243 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.797e-7■■■■■ 26.8
MATR3P43243 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.547e-7■■■■■ 26.8
MATR3P43243 TRIM24-206ENST00000497516 1515 ntTSL 515.73■□□□□ 0.117e-7■■■■■ 26.8
MATR3P43243 SBF2-AS1-205ENST00000527406 666 ntTSL 426.79■■□□□ 1.882e-7■■■■■ 26.8
MATR3P43243 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.752e-7■■■■■ 26.8
MATR3P43243 C16orf87-204ENST00000565112 879 ntTSL 524.7■■□□□ 1.542e-7■■■■■ 26.8
MATR3P43243 MAGI1-209ENST00000476403 622 ntTSL 222.85■■□□□ 1.252e-7■■■■■ 26.8
MATR3P43243 APLP2-208ENST00000526330 582 ntTSL 322.77■■□□□ 1.242e-7■■■■■ 26.8
MATR3P43243 APLP2-213ENST00000529701 573 ntTSL 522.77■■□□□ 1.242e-7■■■■■ 26.8
MATR3P43243 APLP2-209ENST00000527702 579 ntTSL 422.77■■□□□ 1.242e-7■■■■■ 26.8
MATR3P43243 APLP2-223ENST00000534001 585 ntTSL 422.77■■□□□ 1.242e-7■■■■■ 26.8
MATR3P43243 APLP2-220ENST00000533618 574 ntTSL 422.77■■□□□ 1.242e-7■■■■■ 26.8
MATR3P43243 APLP2-221ENST00000533713 560 ntTSL 422.77■■□□□ 1.242e-7■■■■■ 26.8
MATR3P43243 APLP2-224ENST00000534582 556 ntTSL 522.77■■□□□ 1.242e-7■■■■■ 26.8
MATR3P43243 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.222e-7■■■■■ 26.8
MATR3P43243 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.172e-7■■■■■ 26.8
MATR3P43243 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.022e-7■■■■■ 26.8
MATR3P43243 APLP2-219ENST00000533616 2041 ntTSL 220.66■□□□□ 0.92e-7■■■■■ 26.8
MATR3P43243 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.882e-7■■■■■ 26.8
MATR3P43243 HUWE1-201ENST00000218328 5488 ntTSL 520.57■□□□□ 0.882e-7■■■■■ 26.8
Retrieved 100 of 16,209 protein–RNA pairs in 80.2 ms