Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSKP43235 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSKP43235 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSKP43235 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSKP43235 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSKP43235 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSKP43235 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSKP43235 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSKP43235 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSKP43235 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSKP43235 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTSKP43235 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTSKP43235 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTSKP43235 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTSKP43235 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSKP43235 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSKP43235 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSKP43235 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSKP43235 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSKP43235 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSKP43235 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSKP43235 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSKP43235 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSKP43235 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSKP43235 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSKP43235 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSKP43235 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSKP43235 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSKP43235 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSKP43235 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSKP43235 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSKP43235 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSKP43235 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSKP43235 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSKP43235 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSKP43235 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSKP43235 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSKP43235 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSKP43235 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSKP43235 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSKP43235 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSKP43235 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSKP43235 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSKP43235 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSKP43235 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSKP43235 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSKP43235 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSKP43235 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSKP43235 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSKP43235 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSKP43235 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSKP43235 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSKP43235 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSKP43235 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSKP43235 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSKP43235 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSKP43235 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSKP43235 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSKP43235 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSKP43235 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSKP43235 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSKP43235 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSKP43235 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSKP43235 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSKP43235 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSKP43235 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSKP43235 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSKP43235 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSKP43235 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSKP43235 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSKP43235 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSKP43235 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSKP43235 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTSKP43235 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CTSKP43235 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSKP43235 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSKP43235 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSKP43235 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSKP43235 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSKP43235 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSKP43235 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSKP43235 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSKP43235 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSKP43235 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSKP43235 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSKP43235 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSKP43235 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSKP43235 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSKP43235 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSKP43235 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSKP43235 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSKP43235 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSKP43235 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSKP43235 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSKP43235 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSKP43235 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSKP43235 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSKP43235 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSKP43235 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSKP43235 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms