Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGIRP43119 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGIRP43119 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGIRP43119 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms