Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC1A4P43007 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms