Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5CP41229 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
KDM5CP41229 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
KDM5CP41229 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
KDM5CP41229 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
KDM5CP41229 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
KDM5CP41229 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
KDM5CP41229 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
KDM5CP41229 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM5CP41229 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM5CP41229 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM5CP41229 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM5CP41229 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM5CP41229 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM5CP41229 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
KDM5CP41229 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
KDM5CP41229 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
KDM5CP41229 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
KDM5CP41229 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
KDM5CP41229 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
KDM5CP41229 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
KDM5CP41229 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
KDM5CP41229 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms