Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA7P36544 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHRNA7P36544 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms