Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM23P36406 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM23P36406 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms