Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CYLC1P35663 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms