Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTNNA1P35221 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTNNA1P35221 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms