Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CXCR5P32302 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms