Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA11P31270 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA11P31270 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms