Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXA10P31260 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA10P31260 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA10P31260 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms