Protein–RNA interactions for Protein: P31150

GDI1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI1P31150 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDI1P31150 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDI1P31150 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDI1P31150 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDI1P31150 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GDI1P31150 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDI1P31150 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDI1P31150 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GDI1P31150 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GDI1P31150 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDI1P31150 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDI1P31150 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDI1P31150 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDI1P31150 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDI1P31150 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDI1P31150 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDI1P31150 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDI1P31150 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDI1P31150 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDI1P31150 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDI1P31150 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDI1P31150 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDI1P31150 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDI1P31150 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDI1P31150 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDI1P31150 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDI1P31150 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDI1P31150 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDI1P31150 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDI1P31150 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDI1P31150 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GDI1P31150 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDI1P31150 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDI1P31150 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDI1P31150 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDI1P31150 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GDI1P31150 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDI1P31150 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDI1P31150 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDI1P31150 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDI1P31150 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GDI1P31150 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDI1P31150 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDI1P31150 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDI1P31150 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDI1P31150 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDI1P31150 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDI1P31150 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDI1P31150 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDI1P31150 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDI1P31150 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDI1P31150 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDI1P31150 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDI1P31150 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDI1P31150 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDI1P31150 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDI1P31150 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDI1P31150 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDI1P31150 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDI1P31150 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDI1P31150 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDI1P31150 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDI1P31150 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDI1P31150 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDI1P31150 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDI1P31150 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDI1P31150 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDI1P31150 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDI1P31150 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDI1P31150 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDI1P31150 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDI1P31150 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDI1P31150 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDI1P31150 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDI1P31150 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDI1P31150 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDI1P31150 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDI1P31150 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDI1P31150 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDI1P31150 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDI1P31150 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GDI1P31150 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GDI1P31150 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GDI1P31150 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDI1P31150 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDI1P31150 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDI1P31150 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDI1P31150 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDI1P31150 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDI1P31150 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDI1P31150 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDI1P31150 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDI1P31150 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDI1P31150 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDI1P31150 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDI1P31150 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDI1P31150 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GDI1P31150 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GDI1P31150 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GDI1P31150 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms