Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCND3P30281 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCND3P30281 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCND3P30281 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCND3P30281 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCND3P30281 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCND3P30281 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCND3P30281 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCND3P30281 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCND3P30281 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCND3P30281 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCND3P30281 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCND3P30281 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCND3P30281 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCND3P30281 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCND3P30281 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCND3P30281 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCND3P30281 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCND3P30281 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCND3P30281 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCND3P30281 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCND3P30281 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCND3P30281 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCND3P30281 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCND3P30281 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCND3P30281 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCND3P30281 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCND3P30281 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCND3P30281 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCND3P30281 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCND3P30281 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCND3P30281 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCND3P30281 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCND3P30281 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCND3P30281 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCND3P30281 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCND3P30281 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCND3P30281 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCND3P30281 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCND3P30281 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCND3P30281 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCND3P30281 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCND3P30281 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCND3P30281 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCND3P30281 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCND3P30281 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCND3P30281 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCND3P30281 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCND3P30281 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCND3P30281 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCND3P30281 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCND3P30281 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCND3P30281 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCND3P30281 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCND3P30281 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCND3P30281 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCND3P30281 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCND3P30281 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCND3P30281 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCND3P30281 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCND3P30281 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCND3P30281 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCND3P30281 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCND3P30281 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCND3P30281 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCND3P30281 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCND3P30281 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCND3P30281 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCND3P30281 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCND3P30281 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCND3P30281 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCND3P30281 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCND3P30281 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCND3P30281 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCND3P30281 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCND3P30281 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCND3P30281 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCND3P30281 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCND3P30281 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCND3P30281 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCND3P30281 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCND3P30281 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCND3P30281 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCND3P30281 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCND3P30281 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCND3P30281 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCND3P30281 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCND3P30281 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCND3P30281 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCND3P30281 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCND3P30281 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCND3P30281 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCND3P30281 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCND3P30281 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCND3P30281 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCND3P30281 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCND3P30281 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCND3P30281 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCND3P30281 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCND3P30281 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms