Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ECHS1P30084 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ECHS1P30084 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECHS1P30084 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms