Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD34P28906 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD34P28906 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD34P28906 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD34P28906 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD34P28906 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD34P28906 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD34P28906 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD34P28906 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD34P28906 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD34P28906 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD34P28906 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD34P28906 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD34P28906 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD34P28906 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD34P28906 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD34P28906 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD34P28906 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD34P28906 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD34P28906 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD34P28906 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD34P28906 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD34P28906 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD34P28906 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD34P28906 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CD34P28906 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD34P28906 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD34P28906 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD34P28906 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD34P28906 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD34P28906 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD34P28906 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD34P28906 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD34P28906 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD34P28906 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD34P28906 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD34P28906 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD34P28906 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD34P28906 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD34P28906 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD34P28906 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD34P28906 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD34P28906 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD34P28906 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD34P28906 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD34P28906 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD34P28906 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD34P28906 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD34P28906 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD34P28906 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD34P28906 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD34P28906 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD34P28906 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD34P28906 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD34P28906 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD34P28906 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD34P28906 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CD34P28906 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD34P28906 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD34P28906 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD34P28906 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD34P28906 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD34P28906 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD34P28906 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD34P28906 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CD34P28906 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CD34P28906 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CD34P28906 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CD34P28906 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CD34P28906 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CD34P28906 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CD34P28906 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CD34P28906 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CD34P28906 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CD34P28906 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CD34P28906 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CD34P28906 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CD34P28906 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CD34P28906 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CD34P28906 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CD34P28906 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CD34P28906 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CD34P28906 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CD34P28906 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CD34P28906 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CD34P28906 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CD34P28906 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CD34P28906 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CD34P28906 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CD34P28906 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CD34P28906 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CD34P28906 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CD34P28906 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CD34P28906 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CD34P28906 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CD34P28906 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CD34P28906 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CD34P28906 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD34P28906 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD34P28906 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms