Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND1P24385 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND1P24385 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND1P24385 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND1P24385 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND1P24385 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND1P24385 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND1P24385 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND1P24385 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND1P24385 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND1P24385 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND1P24385 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND1P24385 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND1P24385 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND1P24385 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND1P24385 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND1P24385 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND1P24385 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND1P24385 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND1P24385 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND1P24385 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND1P24385 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND1P24385 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND1P24385 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND1P24385 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND1P24385 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND1P24385 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND1P24385 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND1P24385 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND1P24385 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND1P24385 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND1P24385 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND1P24385 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND1P24385 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND1P24385 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCND1P24385 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCND1P24385 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCND1P24385 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCND1P24385 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCND1P24385 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCND1P24385 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCND1P24385 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCND1P24385 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCND1P24385 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCND1P24385 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCND1P24385 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCND1P24385 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCND1P24385 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCND1P24385 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCND1P24385 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCND1P24385 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCND1P24385 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCND1P24385 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND1P24385 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND1P24385 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND1P24385 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND1P24385 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND1P24385 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND1P24385 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND1P24385 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND1P24385 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND1P24385 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND1P24385 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND1P24385 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND1P24385 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCND1P24385 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCND1P24385 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCND1P24385 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCND1P24385 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCND1P24385 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCND1P24385 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCND1P24385 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCND1P24385 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCND1P24385 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCND1P24385 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCND1P24385 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCND1P24385 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCND1P24385 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCND1P24385 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCND1P24385 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCND1P24385 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCND1P24385 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCND1P24385 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCND1P24385 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCND1P24385 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCND1P24385 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCND1P24385 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCND1P24385 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCND1P24385 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCND1P24385 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCND1P24385 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCND1P24385 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCND1P24385 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCND1P24385 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCND1P24385 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCND1P24385 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCND1P24385 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCND1P24385 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCND1P24385 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCND1P24385 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms