Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRBP23467 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms