Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD247P20963 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD247P20963 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD247P20963 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD247P20963 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD247P20963 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD247P20963 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD247P20963 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD247P20963 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD247P20963 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD247P20963 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD247P20963 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD247P20963 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD247P20963 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD247P20963 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD247P20963 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD247P20963 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD247P20963 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD247P20963 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD247P20963 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD247P20963 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD247P20963 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD247P20963 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD247P20963 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD247P20963 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD247P20963 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD247P20963 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD247P20963 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD247P20963 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD247P20963 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD247P20963 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD247P20963 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD247P20963 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD247P20963 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD247P20963 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD247P20963 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD247P20963 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD247P20963 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD247P20963 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD247P20963 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD247P20963 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD247P20963 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD247P20963 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD247P20963 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD247P20963 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD247P20963 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CD247P20963 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CD247P20963 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD247P20963 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CD247P20963 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CD247P20963 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD247P20963 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD247P20963 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD247P20963 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD247P20963 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD247P20963 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD247P20963 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CD247P20963 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD247P20963 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD247P20963 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD247P20963 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD247P20963 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CD247P20963 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD247P20963 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD247P20963 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD247P20963 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD247P20963 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD247P20963 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD247P20963 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD247P20963 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CD247P20963 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CD247P20963 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD247P20963 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CD247P20963 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD247P20963 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CD247P20963 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD247P20963 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CD247P20963 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD247P20963 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD247P20963 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD247P20963 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD247P20963 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CD247P20963 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD247P20963 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD247P20963 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD247P20963 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD247P20963 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD247P20963 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CD247P20963 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD247P20963 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD247P20963 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD247P20963 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD247P20963 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD247P20963 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CD247P20963 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD247P20963 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CD247P20963 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CD247P20963 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CD247P20963 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD247P20963 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms