Protein–RNA interactions for Protein: P20340

RAB6A, Ras-related protein Rab-6A, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6AP20340 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB6AP20340 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB6AP20340 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB6AP20340 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB6AP20340 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB6AP20340 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB6AP20340 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB6AP20340 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB6AP20340 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB6AP20340 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB6AP20340 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB6AP20340 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB6AP20340 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB6AP20340 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB6AP20340 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB6AP20340 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB6AP20340 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB6AP20340 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms