Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB5AP20339 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB5AP20339 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms