Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNFRSF1BP20333 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNFRSF1BP20333 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFRSF1BP20333 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TNFRSF1BP20333 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNFRSF1BP20333 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF1BP20333 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF1BP20333 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF1BP20333 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF1BP20333 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF1BP20333 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF1BP20333 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF1BP20333 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF1BP20333 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF1BP20333 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF1BP20333 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF1BP20333 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF1BP20333 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF1BP20333 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF1BP20333 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF1BP20333 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF1BP20333 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF1BP20333 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF1BP20333 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF1BP20333 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms