Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNA2P20248 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNA2P20248 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNA2P20248 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNA2P20248 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNA2P20248 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNA2P20248 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNA2P20248 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNA2P20248 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNA2P20248 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNA2P20248 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNA2P20248 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNA2P20248 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCNA2P20248 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNA2P20248 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNA2P20248 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNA2P20248 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNA2P20248 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNA2P20248 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNA2P20248 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNA2P20248 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNA2P20248 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNA2P20248 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNA2P20248 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNA2P20248 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNA2P20248 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNA2P20248 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNA2P20248 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNA2P20248 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNA2P20248 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNA2P20248 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNA2P20248 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNA2P20248 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNA2P20248 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNA2P20248 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNA2P20248 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNA2P20248 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNA2P20248 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNA2P20248 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNA2P20248 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNA2P20248 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNA2P20248 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNA2P20248 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNA2P20248 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNA2P20248 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNA2P20248 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNA2P20248 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNA2P20248 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNA2P20248 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCNA2P20248 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNA2P20248 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNA2P20248 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNA2P20248 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNA2P20248 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNA2P20248 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNA2P20248 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNA2P20248 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNA2P20248 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNA2P20248 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNA2P20248 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNA2P20248 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNA2P20248 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNA2P20248 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNA2P20248 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNA2P20248 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNA2P20248 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms