Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCLP19338 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCLP19338 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCLP19338 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NCLP19338 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NCLP19338 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NCLP19338 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCLP19338 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCLP19338 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCLP19338 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCLP19338 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCLP19338 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCLP19338 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCLP19338 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCLP19338 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCLP19338 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCLP19338 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCLP19338 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCLP19338 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCLP19338 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCLP19338 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCLP19338 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCLP19338 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCLP19338 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCLP19338 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCLP19338 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCLP19338 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCLP19338 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCLP19338 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCLP19338 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCLP19338 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCLP19338 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCLP19338 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCLP19338 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCLP19338 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCLP19338 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCLP19338 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCLP19338 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCLP19338 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCLP19338 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCLP19338 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCLP19338 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCLP19338 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCLP19338 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCLP19338 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCLP19338 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCLP19338 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NCLP19338 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCLP19338 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCLP19338 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCLP19338 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCLP19338 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCLP19338 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCLP19338 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCLP19338 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCLP19338 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCLP19338 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCLP19338 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NCLP19338 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCLP19338 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCLP19338 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCLP19338 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCLP19338 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCLP19338 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCLP19338 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCLP19338 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCLP19338 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCLP19338 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCLP19338 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCLP19338 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCLP19338 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCLP19338 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCLP19338 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NCLP19338 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCLP19338 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCLP19338 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCLP19338 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCLP19338 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCLP19338 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCLP19338 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCLP19338 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCLP19338 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCLP19338 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NCLP19338 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCLP19338 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCLP19338 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCLP19338 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCLP19338 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCLP19338 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCLP19338 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCLP19338 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCLP19338 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCLP19338 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCLP19338 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCLP19338 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCLP19338 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCLP19338 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCLP19338 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCLP19338 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCLP19338 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms