Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
ITGB5P18084 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms