Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CKMT2P17540 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CKMT2P17540 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms