Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE6AP16499 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE6AP16499 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE6AP16499 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE6AP16499 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE6AP16499 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE6AP16499 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE6AP16499 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE6AP16499 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE6AP16499 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE6AP16499 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE6AP16499 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE6AP16499 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE6AP16499 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE6AP16499 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE6AP16499 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE6AP16499 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE6AP16499 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE6AP16499 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE6AP16499 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE6AP16499 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE6AP16499 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE6AP16499 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDE6AP16499 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDE6AP16499 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE6AP16499 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE6AP16499 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms