Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSPP15924 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSPP15924 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSPP15924 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSPP15924 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSPP15924 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DSPP15924 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSPP15924 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSPP15924 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSPP15924 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSPP15924 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSPP15924 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSPP15924 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSPP15924 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSPP15924 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DSPP15924 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSPP15924 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSPP15924 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSPP15924 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSPP15924 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSPP15924 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSPP15924 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DSPP15924 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSPP15924 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSPP15924 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DSPP15924 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSPP15924 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSPP15924 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DSPP15924 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSPP15924 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSPP15924 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSPP15924 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSPP15924 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSPP15924 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSPP15924 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSPP15924 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSPP15924 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSPP15924 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSPP15924 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DSPP15924 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSPP15924 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSPP15924 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSPP15924 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSPP15924 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSPP15924 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSPP15924 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSPP15924 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSPP15924 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSPP15924 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSPP15924 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSPP15924 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSPP15924 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSPP15924 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSPP15924 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSPP15924 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSPP15924 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSPP15924 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSPP15924 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSPP15924 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSPP15924 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSPP15924 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSPP15924 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSPP15924 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSPP15924 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSPP15924 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSPP15924 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSPP15924 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSPP15924 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DSPP15924 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSPP15924 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSPP15924 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSPP15924 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSPP15924 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSPP15924 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DSPP15924 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSPP15924 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSPP15924 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSPP15924 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSPP15924 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSPP15924 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSPP15924 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSPP15924 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSPP15924 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSPP15924 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSPP15924 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSPP15924 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSPP15924 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSPP15924 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSPP15924 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSPP15924 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSPP15924 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSPP15924 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSPP15924 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSPP15924 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSPP15924 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSPP15924 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSPP15924 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSPP15924 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSPP15924 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSPP15924 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms