Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD46P15529 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD46P15529 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD46P15529 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD46P15529 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD46P15529 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD46P15529 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD46P15529 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD46P15529 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD46P15529 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD46P15529 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD46P15529 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD46P15529 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD46P15529 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD46P15529 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD46P15529 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CD46P15529 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD46P15529 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD46P15529 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD46P15529 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD46P15529 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD46P15529 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CD46P15529 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD46P15529 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD46P15529 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD46P15529 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD46P15529 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD46P15529 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD46P15529 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CD46P15529 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CD46P15529 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD46P15529 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD46P15529 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD46P15529 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD46P15529 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CD46P15529 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD46P15529 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD46P15529 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD46P15529 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD46P15529 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD46P15529 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD46P15529 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CD46P15529 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD46P15529 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CD46P15529 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD46P15529 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD46P15529 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD46P15529 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD46P15529 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD46P15529 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD46P15529 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD46P15529 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD46P15529 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD46P15529 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD46P15529 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CD46P15529 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD46P15529 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD46P15529 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CD46P15529 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD46P15529 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD46P15529 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD46P15529 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD46P15529 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD46P15529 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD46P15529 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD46P15529 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD46P15529 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD46P15529 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD46P15529 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD46P15529 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD46P15529 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD46P15529 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD46P15529 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD46P15529 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD46P15529 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD46P15529 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD46P15529 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD46P15529 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD46P15529 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD46P15529 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD46P15529 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD46P15529 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD46P15529 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD46P15529 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD46P15529 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CD46P15529 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CD46P15529 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD46P15529 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD46P15529 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD46P15529 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD46P15529 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD46P15529 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD46P15529 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CD46P15529 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD46P15529 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD46P15529 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD46P15529 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD46P15529 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD46P15529 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD46P15529 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms