Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF2P15336 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF2P15336 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF2P15336 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF2P15336 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF2P15336 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF2P15336 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF2P15336 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF2P15336 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF2P15336 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF2P15336 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF2P15336 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF2P15336 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF2P15336 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF2P15336 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF2P15336 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF2P15336 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF2P15336 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF2P15336 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF2P15336 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF2P15336 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF2P15336 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF2P15336 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF2P15336 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF2P15336 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF2P15336 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF2P15336 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF2P15336 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF2P15336 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF2P15336 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF2P15336 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF2P15336 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF2P15336 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF2P15336 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF2P15336 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF2P15336 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF2P15336 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF2P15336 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF2P15336 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF2P15336 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF2P15336 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF2P15336 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF2P15336 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF2P15336 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF2P15336 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF2P15336 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF2P15336 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF2P15336 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF2P15336 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF2P15336 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF2P15336 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF2P15336 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF2P15336 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF2P15336 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF2P15336 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF2P15336 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF2P15336 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF2P15336 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF2P15336 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF2P15336 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF2P15336 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF2P15336 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF2P15336 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF2P15336 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF2P15336 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF2P15336 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF2P15336 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF2P15336 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF2P15336 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF2P15336 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF2P15336 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF2P15336 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF2P15336 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF2P15336 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF2P15336 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF2P15336 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF2P15336 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF2P15336 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF2P15336 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF2P15336 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF2P15336 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF2P15336 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF2P15336 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF2P15336 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF2P15336 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF2P15336 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF2P15336 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF2P15336 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF2P15336 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF2P15336 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF2P15336 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF2P15336 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF2P15336 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF2P15336 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF2P15336 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF2P15336 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF2P15336 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF2P15336 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF2P15336 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF2P15336 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms