Protein–RNA interactions for Protein: P15088

CPA3, Mast cell carboxypeptidase A, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA3P15088 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA3P15088 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA3P15088 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA3P15088 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA3P15088 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA3P15088 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA3P15088 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA3P15088 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA3P15088 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA3P15088 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA3P15088 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA3P15088 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA3P15088 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA3P15088 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA3P15088 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA3P15088 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA3P15088 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA3P15088 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA3P15088 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA3P15088 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA3P15088 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA3P15088 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA3P15088 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA3P15088 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA3P15088 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA3P15088 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA3P15088 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA3P15088 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA3P15088 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA3P15088 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA3P15088 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA3P15088 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA3P15088 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA3P15088 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA3P15088 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA3P15088 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA3P15088 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA3P15088 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA3P15088 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA3P15088 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA3P15088 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA3P15088 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA3P15088 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA3P15088 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA3P15088 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA3P15088 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA3P15088 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA3P15088 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA3P15088 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA3P15088 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA3P15088 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA3P15088 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA3P15088 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA3P15088 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA3P15088 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA3P15088 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA3P15088 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA3P15088 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA3P15088 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA3P15088 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA3P15088 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA3P15088 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CPA3P15088 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CPA3P15088 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA3P15088 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA3P15088 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA3P15088 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA3P15088 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA3P15088 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA3P15088 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA3P15088 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA3P15088 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA3P15088 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA3P15088 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA3P15088 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA3P15088 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA3P15088 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA3P15088 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA3P15088 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA3P15088 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA3P15088 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA3P15088 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA3P15088 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA3P15088 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA3P15088 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA3P15088 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA3P15088 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA3P15088 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA3P15088 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA3P15088 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA3P15088 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA3P15088 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA3P15088 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA3P15088 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA3P15088 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA3P15088 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA3P15088 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA3P15088 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA3P15088 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA3P15088 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms