Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB1P14653 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB1P14653 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms