Protein–RNA interactions for Protein: P13671

C6, Complement component C6, humanhuman

Predictions only

Length 934 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6P13671 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6P13671 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6P13671 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6P13671 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6P13671 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6P13671 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6P13671 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6P13671 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6P13671 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6P13671 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6P13671 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6P13671 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6P13671 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6P13671 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6P13671 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6P13671 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6P13671 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6P13671 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6P13671 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6P13671 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6P13671 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6P13671 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6P13671 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6P13671 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6P13671 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6P13671 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6P13671 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6P13671 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C6P13671 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6P13671 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6P13671 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6P13671 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6P13671 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6P13671 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6P13671 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6P13671 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6P13671 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6P13671 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6P13671 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6P13671 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6P13671 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6P13671 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6P13671 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6P13671 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C6P13671 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C6P13671 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C6P13671 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C6P13671 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C6P13671 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C6P13671 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C6P13671 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C6P13671 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C6P13671 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C6P13671 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C6P13671 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C6P13671 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C6P13671 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C6P13671 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C6P13671 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C6P13671 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C6P13671 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C6P13671 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C6P13671 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C6P13671 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C6P13671 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C6P13671 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C6P13671 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C6P13671 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C6P13671 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C6P13671 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C6P13671 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6P13671 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6P13671 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6P13671 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6P13671 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6P13671 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6P13671 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6P13671 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6P13671 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6P13671 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C6P13671 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6P13671 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6P13671 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C6P13671 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
C6P13671 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C6P13671 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C6P13671 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C6P13671 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C6P13671 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C6P13671 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C6P13671 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C6P13671 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C6P13671 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C6P13671 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C6P13671 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C6P13671 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C6P13671 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C6P13671 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C6P13671 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C6P13671 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms