Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT10P13645 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT10P13645 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT10P13645 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT10P13645 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT10P13645 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT10P13645 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT10P13645 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT10P13645 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT10P13645 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT10P13645 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT10P13645 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT10P13645 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT10P13645 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT10P13645 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT10P13645 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT10P13645 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT10P13645 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT10P13645 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT10P13645 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT10P13645 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT10P13645 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT10P13645 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT10P13645 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT10P13645 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT10P13645 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT10P13645 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT10P13645 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT10P13645 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT10P13645 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT10P13645 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT10P13645 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT10P13645 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT10P13645 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT10P13645 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT10P13645 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT10P13645 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT10P13645 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT10P13645 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT10P13645 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT10P13645 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT10P13645 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT10P13645 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT10P13645 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT10P13645 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT10P13645 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT10P13645 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT10P13645 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT10P13645 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT10P13645 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT10P13645 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT10P13645 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT10P13645 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT10P13645 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT10P13645 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT10P13645 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT10P13645 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT10P13645 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT10P13645 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT10P13645 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT10P13645 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT10P13645 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT10P13645 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT10P13645 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT10P13645 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT10P13645 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT10P13645 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT10P13645 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT10P13645 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT10P13645 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT10P13645 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT10P13645 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT10P13645 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT10P13645 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT10P13645 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT10P13645 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT10P13645 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT10P13645 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT10P13645 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT10P13645 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT10P13645 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT10P13645 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT10P13645 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT10P13645 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT10P13645 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT10P13645 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT10P13645 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT10P13645 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT10P13645 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT10P13645 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT10P13645 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT10P13645 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT10P13645 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT10P13645 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT10P13645 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT10P13645 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT10P13645 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT10P13645 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT10P13645 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT10P13645 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms