Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CKBP12277 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CKBP12277 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CKBP12277 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CKBP12277 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CKBP12277 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CKBP12277 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CKBP12277 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CKBP12277 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CKBP12277 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CKBP12277 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CKBP12277 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CKBP12277 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKBP12277 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKBP12277 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKBP12277 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKBP12277 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CKBP12277 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKBP12277 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKBP12277 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKBP12277 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKBP12277 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CKBP12277 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CKBP12277 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CKBP12277 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CKBP12277 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CKBP12277 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CKBP12277 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CKBP12277 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CKBP12277 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CKBP12277 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CKBP12277 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CKBP12277 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CKBP12277 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CKBP12277 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CKBP12277 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CKBP12277 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CKBP12277 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CKBP12277 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKBP12277 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKBP12277 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKBP12277 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKBP12277 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKBP12277 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKBP12277 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKBP12277 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKBP12277 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKBP12277 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKBP12277 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKBP12277 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKBP12277 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKBP12277 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKBP12277 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKBP12277 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKBP12277 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CKBP12277 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CKBP12277 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CKBP12277 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CKBP12277 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CKBP12277 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CKBP12277 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CKBP12277 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CKBP12277 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CKBP12277 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CKBP12277 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CKBP12277 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CKBP12277 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CKBP12277 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CKBP12277 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CKBP12277 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CKBP12277 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CKBP12277 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CKBP12277 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CKBP12277 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CKBP12277 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CKBP12277 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CKBP12277 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CKBP12277 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CKBP12277 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CKBP12277 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CKBP12277 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CKBP12277 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CKBP12277 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CKBP12277 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CKBP12277 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CKBP12277 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CKBP12277 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CKBP12277 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKBP12277 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKBP12277 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKBP12277 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKBP12277 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKBP12277 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKBP12277 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKBP12277 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKBP12277 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CKBP12277 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKBP12277 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKBP12277 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKBP12277 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms