Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HARSP12081 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HARSP12081 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HARSP12081 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HARSP12081 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HARSP12081 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HARSP12081 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HARSP12081 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HARSP12081 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HARSP12081 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HARSP12081 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HARSP12081 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HARSP12081 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HARSP12081 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HARSP12081 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HARSP12081 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HARSP12081 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HARSP12081 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HARSP12081 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HARSP12081 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HARSP12081 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HARSP12081 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HARSP12081 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HARSP12081 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HARSP12081 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HARSP12081 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HARSP12081 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HARSP12081 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HARSP12081 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HARSP12081 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HARSP12081 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HARSP12081 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HARSP12081 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HARSP12081 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HARSP12081 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HARSP12081 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HARSP12081 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HARSP12081 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HARSP12081 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HARSP12081 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HARSP12081 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HARSP12081 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HARSP12081 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HARSP12081 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HARSP12081 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HARSP12081 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HARSP12081 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HARSP12081 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HARSP12081 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HARSP12081 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HARSP12081 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HARSP12081 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HARSP12081 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HARSP12081 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HARSP12081 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HARSP12081 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HARSP12081 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HARSP12081 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HARSP12081 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HARSP12081 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HARSP12081 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HARSP12081 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HARSP12081 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HARSP12081 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HARSP12081 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HARSP12081 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HARSP12081 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HARSP12081 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HARSP12081 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HARSP12081 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HARSP12081 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HARSP12081 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HARSP12081 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HARSP12081 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HARSP12081 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HARSP12081 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HARSP12081 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HARSP12081 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HARSP12081 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HARSP12081 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HARSP12081 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HARSP12081 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HARSP12081 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HARSP12081 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HARSP12081 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HARSP12081 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HARSP12081 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HARSP12081 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HARSP12081 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HARSP12081 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HARSP12081 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HARSP12081 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HARSP12081 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HARSP12081 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HARSP12081 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HARSP12081 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HARSP12081 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HARSP12081 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HARSP12081 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HARSP12081 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms