Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT3P12035 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT3P12035 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT3P12035 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT3P12035 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT3P12035 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT3P12035 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT3P12035 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT3P12035 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT3P12035 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT3P12035 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT3P12035 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT3P12035 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT3P12035 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT3P12035 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT3P12035 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT3P12035 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT3P12035 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT3P12035 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT3P12035 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT3P12035 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT3P12035 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT3P12035 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT3P12035 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT3P12035 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT3P12035 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT3P12035 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT3P12035 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT3P12035 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT3P12035 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT3P12035 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT3P12035 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT3P12035 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT3P12035 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT3P12035 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT3P12035 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT3P12035 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT3P12035 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT3P12035 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT3P12035 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT3P12035 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT3P12035 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT3P12035 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT3P12035 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT3P12035 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT3P12035 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT3P12035 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT3P12035 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT3P12035 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT3P12035 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT3P12035 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT3P12035 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT3P12035 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT3P12035 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT3P12035 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT3P12035 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT3P12035 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT3P12035 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT3P12035 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT3P12035 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT3P12035 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT3P12035 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT3P12035 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT3P12035 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT3P12035 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT3P12035 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT3P12035 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT3P12035 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT3P12035 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT3P12035 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT3P12035 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT3P12035 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT3P12035 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT3P12035 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT3P12035 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT3P12035 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT3P12035 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT3P12035 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT3P12035 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT3P12035 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT3P12035 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT3P12035 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT3P12035 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT3P12035 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT3P12035 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT3P12035 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT3P12035 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT3P12035 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT3P12035 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT3P12035 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT3P12035 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT3P12035 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT3P12035 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT3P12035 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT3P12035 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT3P12035 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT3P12035 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT3P12035 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT3P12035 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT3P12035 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms