Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK4P11802 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK4P11802 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK4P11802 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK4P11802 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK4P11802 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK4P11802 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK4P11802 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK4P11802 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK4P11802 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK4P11802 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK4P11802 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK4P11802 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK4P11802 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK4P11802 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK4P11802 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK4P11802 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK4P11802 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK4P11802 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK4P11802 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK4P11802 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK4P11802 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK4P11802 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK4P11802 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK4P11802 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK4P11802 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK4P11802 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK4P11802 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK4P11802 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK4P11802 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK4P11802 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK4P11802 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK4P11802 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK4P11802 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK4P11802 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK4P11802 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK4P11802 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK4P11802 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK4P11802 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK4P11802 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK4P11802 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK4P11802 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK4P11802 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK4P11802 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK4P11802 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK4P11802 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK4P11802 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK4P11802 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK4P11802 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK4P11802 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK4P11802 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK4P11802 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK4P11802 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK4P11802 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK4P11802 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK4P11802 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK4P11802 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK4P11802 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK4P11802 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK4P11802 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK4P11802 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK4P11802 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK4P11802 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK4P11802 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK4P11802 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK4P11802 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK4P11802 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK4P11802 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK4P11802 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK4P11802 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK4P11802 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK4P11802 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK4P11802 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK4P11802 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK4P11802 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK4P11802 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK4P11802 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK4P11802 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK4P11802 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK4P11802 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK4P11802 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK4P11802 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK4P11802 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK4P11802 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK4P11802 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK4P11802 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK4P11802 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK4P11802 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK4P11802 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK4P11802 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK4P11802 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK4P11802 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK4P11802 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK4P11802 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK4P11802 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK4P11802 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK4P11802 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK4P11802 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK4P11802 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK4P11802 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms