Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
GLI2P10070 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
GLI2P10070 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
GLI2P10070 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
GLI2P10070 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
GLI2P10070 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
GLI2P10070 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
GLI2P10070 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
GLI2P10070 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
GLI2P10070 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
GLI2P10070 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
GLI2P10070 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
GLI2P10070 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
GLI2P10070 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
GLI2P10070 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
GLI2P10070 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
GLI2P10070 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
GLI2P10070 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
GLI2P10070 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GLI2P10070 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
GLI2P10070 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GLI2P10070 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
GLI2P10070 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GLI2P10070 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
GLI2P10070 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
GLI2P10070 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
GLI2P10070 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
GLI2P10070 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
GLI2P10070 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
GLI2P10070 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
GLI2P10070 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
GLI2P10070 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
GLI2P10070 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
GLI2P10070 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
GLI2P10070 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
GLI2P10070 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
GLI2P10070 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
GLI2P10070 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
GLI2P10070 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
GLI2P10070 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
GLI2P10070 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
GLI2P10070 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
GLI2P10070 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
GLI2P10070 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
GLI2P10070 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
GLI2P10070 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
GLI2P10070 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
GLI2P10070 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
GLI2P10070 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
GLI2P10070 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC35.49■■■■□ 3.27
GLI2P10070 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
GLI2P10070 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GLI2P10070 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GLI2P10070 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
GLI2P10070 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GLI2P10070 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
GLI2P10070 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GLI2P10070 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GLI2P10070 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GLI2P10070 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GLI2P10070 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
GLI2P10070 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
GLI2P10070 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
GLI2P10070 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC35.47■■■■□ 3.27
GLI2P10070 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
GLI2P10070 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
GLI2P10070 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
GLI2P10070 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
GLI2P10070 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
GLI2P10070 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
GLI2P10070 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
GLI2P10070 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
GLI2P10070 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
GLI2P10070 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
GLI2P10070 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
GLI2P10070 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
GLI2P10070 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
GLI2P10070 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
GLI2P10070 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
GLI2P10070 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
GLI2P10070 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
GLI2P10070 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
GLI2P10070 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
GLI2P10070 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
GLI2P10070 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
GLI2P10070 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
GLI2P10070 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
GLI2P10070 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
GLI2P10070 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
GLI2P10070 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
GLI2P10070 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
GLI2P10070 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
GLI2P10070 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
GLI2P10070 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
GLI2P10070 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
GLI2P10070 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
GLI2P10070 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
GLI2P10070 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
GLI2P10070 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
GLI2P10070 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms