Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM225BP0DP42 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms