Protein–RNA interactions for Protein: P09012

SNRPA, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPAP09012 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPAP09012 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms