Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTNP04004 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTNP04004 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTNP04004 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTNP04004 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTNP04004 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTNP04004 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTNP04004 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTNP04004 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTNP04004 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTNP04004 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTNP04004 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTNP04004 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTNP04004 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VTNP04004 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VTNP04004 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VTNP04004 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VTNP04004 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VTNP04004 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VTNP04004 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTNP04004 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VTNP04004 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTNP04004 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTNP04004 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTNP04004 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTNP04004 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTNP04004 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTNP04004 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTNP04004 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTNP04004 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VTNP04004 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTNP04004 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTNP04004 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTNP04004 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTNP04004 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VTNP04004 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VTNP04004 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTNP04004 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTNP04004 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTNP04004 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VTNP04004 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VTNP04004 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VTNP04004 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VTNP04004 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VTNP04004 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VTNP04004 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VTNP04004 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VTNP04004 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VTNP04004 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTNP04004 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTNP04004 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTNP04004 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTNP04004 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTNP04004 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTNP04004 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTNP04004 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTNP04004 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VTNP04004 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTNP04004 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VTNP04004 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTNP04004 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTNP04004 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTNP04004 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTNP04004 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTNP04004 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTNP04004 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTNP04004 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTNP04004 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VTNP04004 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VTNP04004 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VTNP04004 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VTNP04004 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VTNP04004 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VTNP04004 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VTNP04004 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VTNP04004 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VTNP04004 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VTNP04004 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VTNP04004 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VTNP04004 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VTNP04004 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VTNP04004 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VTNP04004 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VTNP04004 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VTNP04004 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VTNP04004 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VTNP04004 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VTNP04004 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTNP04004 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTNP04004 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTNP04004 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VTNP04004 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTNP04004 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VTNP04004 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTNP04004 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTNP04004 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTNP04004 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTNP04004 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTNP04004 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTNP04004 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms