Protein–RNA interactions for Protein: P02461

COL3A1, Collagen alpha-1(III) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL3A1P02461 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
COL3A1P02461 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
COL3A1P02461 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
COL3A1P02461 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.3 ms