Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
HLA-AP01891 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms