Protein–RNA interactions for Protein: P01011

SERPINA3, Alpha-1-antichymotrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA3P01011 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINA3P01011 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms